Všechny obce mikroregionu jsou součástí území, na kterém je veřejná doprava zajišťována Integrovaným dopravním systémem Jihomoravského kraje. Obslužnost většiny obcí je dostačující a velká část z nich má rovněž velmi dobré podmínky pro využívání silniční a železniční dopravy. Autobusová doprava je zajišťována společnostmi BORS Břeclav a.s., Tourbus, a.s. Brno, VYDOS BUS a.s. Vyškov, ČSAD Hodonín a.s. nebo ADOSA a.s. Rosice; železniční pak Českými drahami, a.s.
Zájmovým územím vede také železniční trať č. 250 Brno – Břeclav – hraniční přechod Břeclav/Kúty* (stanice Pouzdřany, Popice, Šakvice a Zaječí). Na řešené území zasahují ještě další dvě železniční neelektrifikované trati spíše regionálního významu. Jedná se o trať č. 254 Šakvice – Hustopeče u Brna, která plní funkci přípojky největšího města na hlavní výše popsanou železniční trať (č. 250). Druhou z nich je pak trať č. 255 Hodonín – Zaječí (zastávky Brumovice, Kobylí, Bořetice, Velké Pavlovice a Zaječí).
Tab.: Přehled komunikací II. třídy procházející mikroregionem Hustopečsko
Obr.: Úsek železniční traťi č. 250 Brno – Břeclav – hraniční přechod Břeclav/Kúty vedoucí mikroregionem Hustopečsko
* Tato trať je součástí tzv. I. železničního koridoru (ten spojuje přes území ČR – Děčín, Ústí nad Labem, Praha, Pardubice, Česká Třebová, Brno a Břeclav Německo s Rakouskem) a zároveň je zařazena do železniční části panevropského multimodálního koridoru č. IV. (trasa Norimberk/Berlín – Praha – Budapešť – Istanbul).
SILNIČNÍ A ŽELEZNIČNÍ DOPRAVA
Územím mikroregionu Hustopečsko ve směru severozápad – jihovýchod prochází dálnice D2 vedoucí z Brna přes Hustopeče, Břeclav na hraniční přechod Břeclav/Brodské na Slovensko, která je v úseku Brno – Bratislava zařazena pod číslem E65 do sítě evropských silnic a do sítí TINA. Další významné silnice na území mikroregionu jsou už pouze silnice II. třídy (viz tabulka) – významné silnice II. třídy pak tvoří spojnici Brna s Břeclaví a Brna s Hodonínem. Tuto soustavu doplňují silnice III. třídy, které jsou však mnohdy ve špatném technickém stavu.